白癜风与自身免疫的关系非常受重视。因为白癜风患者中20%－30%伴有自家免疫及内分泌疾病，如甲状腺、糖尿病、慢性肾上腺皮质功能不足等。常伴有的免疫性疾病还有类风湿关节炎、红斑狼疮、硬皮病、局灶性结肠炎、重症肌无力、恶性贫血、自身免疫性溶血性贫血、异常丙种球蛋白血症、斑秃、支气管哮喘、异位皮炎等。白癜风患者亲属中患自身免疫病者显著的增多。在自身免疫疾病病人中，白癜风发生率较一般人群高10－15倍。

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