什么是合作医疗公益金呢？其实合作医疗公益金具有一定的公益性和福利性，既不同于社会保险，也不同于商业保险，正是合作医疗公益金的这种特殊性决定了合作医疗公益金运行管理的基本要求是公正、低成本。公正，要求该补的补到位，不应当的支出绝不支出；低成本，要求把管理费控制在一定幅度内。这才被叫做真正的合作医疗公益金。

　　怎样做到以上所说的呢？首先实行资金专户管理、专款专用。严格实行收支分离，管用分开，封闭运行的公益金安全管理办法。做到“财政部门管账不管钱，银行管钱不用钱，合作医疗管理办用钱不见钱”。形成医疗机构、合作医疗经办机构、财政部门和农业银行四方互相监督的公益金运行机制，保障公益金运行安全，不会出现任何大的差错。

　　除以上的那些措施以外，还实行管办分离。卫生院具有提供医疗服务和管理合作医疗的双重职能，长远看，不利于合作医疗的可持续发展。卫生院的这种双重职能不利于控制医疗费用的不合理增长，使合作医疗公益金随时面临着收支失衡的危险。我们不只一次地听到农户反映乡镇卫生院为增加收入，存在着有意拖延疗程、延长病人住院时间的做法。“管办分离”模式是将合作医疗经办机构和医疗机构分离，从理顺合作医疗管理体制上，保证合作医疗资金的安全运转。防止出现资金短缺的现象。

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